后期三控是指烟苗6-7片真叶时进入炼苗阶段。这阶段通常采用：
1、揭膜日晒炼苗。主要是使叶片老化壮实，茎杆粗壮，根系发达，移栽后缩短返青期，又不致于枯萎。
2、剪叶炼苗。用锐利剪刀或特制镰刀，去掉大苗叶片的1/3，连续两至三次，起到控大苗、促小苗作用，控制叶片生长，促进根系发达。
3、断水炼苗。此外，还可以采取断水炼苗，通过揭膜促使畦中水分消耗蒸腾，从而控制幼苗生长。
